Disciplinas
As disciplinas obrigatórias são oferecidas pelo menos uma vez por ano letivo; já as disciplinas eletivas são oferecidas de acordo com a disponibilidade do programa.
As disciplinas do PPG-ERN, com exceção de Pesquisa de Dissertação de Mestrado (LCA-2726) e Pesquisa de Tese de Doutorado (LCA-2801), são divididas nas seguintes áreas:
| Código | Disciplinas | Créditos | Natureza | Coordenador | |
| GERAL | LCA-2725 | Ecologia de Campo | 06 | obrigatória | Dr. Marcos Salomão |
| LCA-2730 | Ecologia de Comunidades | 04 | eletiva | ||
| variado | Estágio de Docência I, II | variado | obrigatória | Dr.ª Angela Pierre Vitória | |
| variado | Seminários em Ciências Ambientais I, II, III, IV | 01 | obrigatória | Dr. Carlos Eduardo de Rezende | |
| variado | Tópicos Especiais em Ecologia e Recursos Naturais | variado | eletiva | variado | |
| LCA 2748 | Planejamento Ambiental | 03 | eletiva | Dr. Marcos Pedlowski | |
| METODOLÓGICAS | LCA-2609 | Técnicas Analíticas em Ciências Ambientais | 04 | eletiva | |
| LCA-2719 | Ecologia Marinha Quantitativa | 03 | eletiva | Dr. Ricardo Coutinho | |
| LCA-2702 | Métodos de Análise de Vegetação | 06 | eletiva | Dr. Marcelo T. Nascimento | |
| LCA-2735 | Trabalho Acadêmico- Científico: Redação e Organização | 02 | eletiva | Drª Ana Paula Di Beneditto | |
| variado | Disciplina(s) na área de Estatística* | obrigatória | |||
| LCA 2613 | *Biometria (oferecida pelo LCA) | 05 | eletiva | Dr. Leandro Rabello Monteiro | |
| ECOLOGIA DE ECOSSISTEMAS E ORGANISMOS |
LCA-2701 | Geoquímica Ambiental | 02 | eletiva | Dr. Marcos Sarmet Salomão |
| LCA-2703 | Ciclagem de Nutrientes em Ecossistemas Terrestres | 03 | eletiva | Drª Dora Villela José | |
| LCA-2704 | Aplicação de Isótopos Estáveis e Biomarcadores em Ecologia | 03 | eletiva | Dr. Carlos Eduardo de Rezende | |
| LCA-2720 | Biogeoquímica de Metais Pesados | 04 | eletiva | Drª. Cristina Maria Magalhães | |
| LCA-2721 | Ecologia de Lagoas Costeiras | 04 | eletiva | Drª. Marina Suzuki | |
| LCA-2728 | Relações Hídricas e Fotossíntese | 02 | eletiva | Drª Ângela Pierre Vitória | |
| LCA 2614 | Conservação e Manejo de Ecossistemas Costeiros | 02 | eletiva | Dr. Carlos Eduardo de Rezende | |
| LCA 2748 | Planejamento Ambiental | 03 | eletiva | Dr. Marcos Pedlowski | |
| ECOLOGIA DE ECOSSISTEMAS E ORGANISMOS | LCA-2606 | Etologia | 04 | eletiva | Dr. Carlos Ruiz Miranda |
| LCA-2710 | Ecologia das Interações Inseto-Planta | 03 | eletiva | Dr. Marcelo T. Nascimento; Drª Maria Cristina Gaglianone | |
| LCA-2714 | Bioincrustação | 03 | eletiva | Drª Ilana Rosental Zalmon | |
| LCA-2733 | Ecologia de Costão Rochoso | 04 | eletiva | Drª Ilana Rosental Zalmon | |
| LCA-2731 | Ecologia de Populações | 03 | eletiva | Drª Maria Cristina Gaglianone | |