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O Herbário do Centro de Biociências e Biotecnologia (HUENF) foi criado no dia 03/06/2005 pelo Conselho do Centro de Biociências e Biotecnologia (CBB), ocupando uma sala nas dependências do referido Centro. Esse Herbário é um importante banco de informações, sendo o único na região, carente de estudos florísticos. Com isso podemos unir forças para o levantamento e conhecimento da flora do Rio de Janeiro junto a Rede Fluminense de Herbários (RFH).
O Herbário UENF é formado por coleções oriundas das diferentes fisionomias ocorrentes no diversificado e quase desconhecido mosaico que é a região Norte Fluminense. Este acervo botânico-científico constitui um importante banco de informações, sendo o único na região. O seu valor científico é inestimável, visto ser base para qualquer trabalho na área da botânica, ecologia vegetal e de agroecologia