A Prefeitura da UENF é responsável pelo desenvolvimento de ações para o planejamento, operação e controle da estrutura física, relacionadas às atividades de engenharia (projetos, orçamento, fiscalização e obras), manutenção (limpeza, manutenção predial, manutenção de piscina, manutenção de áreas verdes, manutenção de geradores), transporte (manutenção de veículos), restaurante universitário, centro de convenções, enfermaria, zeladoria, recepção, segurança.

Estamos presentes em seis municípios do Estado do Rio de Janeiro: i) Município de Campos dos Goytacazes: Campus Leonel Brizola, a Casa de Cultura Villa Maria, Unidade Experimental da UENF Antonio Sarlo, Parque Tecnológico Agropecuário, Unidade Experimental da UENF PESAGRO; ii) Município de Macaé: Campus Carlos Alberto Dias; iii) Município de Itaocara: Unidade Experimental da UENF de Produção Vegetal; iv) Município de Rio das Ostra: Campus UENF Reserva Biológica União; v) Município de Cabo Frio: Campus UENF Fazenda Campos Novos; vi) Italva: em implantação.